shRNA inserts
|
EYA4
|
F: 5′-GATCCCGCACTTAAGTCTTTATCAATTCAAGAGATTGATAAAGACTTAAGTGCTTTTTTCCAAA-3′
|
64
|
R: 5′-AGCTTTTGGAAAAAAGCACTTAAGTCTTTATCAATCTCTTGAATTGATAAAGACTTAAGTGCGG-3′
|
64
|
Scramble
|
F: 5′-GATCCCGTCTCATTATTGCTAAACAGTTGATATCCGCTGTTTAGCAATAATGAGATTTTTTCCAAA-3′
|
66
|
R: 5′-AGCTTTTGGAAAAAATCTCATTATTGCTAAACAGCGGATATCAACTGTTTAGCAATAATGAGACGG-3′
|
66
|
qRT-PCR
|
EYA4
|
F: 5′-GAATAACACAGCCGATGG-3′
|
18
|
R: 5′-CCAGGTCACTATCAGGAG-3′
|
18
|
RAP1A
|
F: 5′-CTCCTGAACCAAGGACCACT-3′
|
20
|
R: 5′-TGTGTCTCACTGCACCTTCA-3′
|
20
|
BCL-2
|
F: 5′-GAGAAATCAAACAGAGGCCG-3′
|
20
|
R: 5′-CTGAGTACCTGAACCGGCA-3′
|
19
|
CCND1
|
F: 5′-GGCGGATTGGAAATGAACTT-3′
|
20
|
R: 5′-TCCTCTCCAAAATGCCAGAG-3′
|
20
|
TWIST1
|
F: 5′-TCCATTTTCTCCTTCTCTGGAA-3′
|
22
|
R: 5′-GTCCGCGTCCCACTAGC-3′
|
17
|
XIAP
|
F: 5′-GACCCTCCCCTTGGACC-3′
|
17
|
R: 5′-CTGTTAAAAGTCATCTTCTCTTGAAA-3′
|
26
|
GAPDH
|
F: 5′-AATCCCATCACCATCTTCCA-3′
|
20
|
R: 5′-TGGACTCCACGACGTACTCA-3′
|
20
|
ChIP
|
RAP1A promoter
|
F: 5′-CATAAGCATTTACCAGGAAAATGG-3′
|
24
|
R: 5′-GGTTCCTAACAGATGATGGAAA-3′
|
22
|